Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME9Q86XW9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME9Q86XW9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms