Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCA5Q86VQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCA5Q86VQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms