Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSPH3Q86UC2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSPH3Q86UC2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms