Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PBRM1Q86U86 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PBRM1Q86U86 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms