Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLNKQ7Z7G1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms