Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2Q1Q7Z7E8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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