Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms