Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SRCAPQ6ZRS2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms