Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRSAM1Q6UWE0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms