Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C16orf54Q6UWD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms