Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms