Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms