Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 30.96□□□□□ -2.269e-12■■■■■ 40.9
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PRPF8Q6P2Q9 ELOVL1-205ENST00000468865 797 ntTSL 39.04□□□□□ -0.964e-10■■■■■ 40.8
PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-206ENST00000585958 575 ntTSL 42.14□□□□□ -2.075e-10■■■■■ 40.8
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PRPF8Q6P2Q9 AZI2-207ENST00000457172 1136 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 40.6
PRPF8Q6P2Q9 AZI2-201ENST00000295748 3127 ntTSL 1 (best)5.74□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 40.6
PRPF8Q6P2Q9 WDR45B-202ENST00000571767 789 ntTSL 210.73□□□□□ -0.699e-10■■■■■ 40.6
PRPF8Q6P2Q9 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 40.6
PRPF8Q6P2Q9 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 40.6
PRPF8Q6P2Q9 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.991e-11■■■■■ 40.6
PRPF8Q6P2Q9 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.891e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 212.64□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 EPB41L5-204ENST00000443902 3167 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 MTHFD2-207ENST00000488086 483 ntTSL 27.34□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0368-205ENST00000602447 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.67□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 PCM1-204ENST00000517730 2536 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.014e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 AZIN1-207ENST00000520402 660 ntTSL 411.29□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 40.5
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