Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms