Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H3F3CQ6NXT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms