Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRRC8EQ6NSJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms