Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP4Q6FHJ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP4Q6FHJ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFRP4Q6FHJ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms