Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA2Q69YH5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms