Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf57Q5W0N0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms