Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM78BQ5VT40 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms