Protein–RNA interactions for Protein: Q5T8R8

C9orf66, Uncharacterized protein C9orf66, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66Q5T8R8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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C9orf66Q5T8R8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C9orf66Q5T8R8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf66Q5T8R8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf66Q5T8R8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf66Q5T8R8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C9orf66Q5T8R8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf66Q5T8R8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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