Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D1BQ5T0F9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D1BQ5T0F9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D1BQ5T0F9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms