Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF3Q5SZQ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms