Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms