Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARS2Q5ST30 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms