Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAT1Q5SQI0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAT1Q5SQI0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms