Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
SAMD9Q5K651 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SAMD9Q5K651 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SAMD9Q5K651 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms