Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HABP4Q5JVS0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms