Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC4Q5GLZ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms