Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms