Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms