Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UVSSAQ2YD98 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms