Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VWC2Q2TAL6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms