Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL8BQ17RB0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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