Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IMPG1Q17R60 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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