Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX1AQ16623 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX1AQ16623 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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