Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACKR1Q16570 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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