Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDB1Q16531 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
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