Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA2Q15822 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms