Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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