Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP13Q15645 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP13Q15645 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms