Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIP11Q15643 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms