Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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SEC23BQ15437 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC23BQ15437 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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