Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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