Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFRLQ15198 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms