Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM2Q15035 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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