Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFTN1Q14699 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms