Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms