Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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