Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE4AQ14139 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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